В ходе структурных реформ в сфере здравоохранения в 2009 году была завершена работа в области ликвидации части ранее не функционировавших медицинских учреждений и начат процесс уменьшения фонда коечных мест на этих объектах. Как сообщает 1news.az со ссылкой на пресс-службу Министерства здравоохранения Азербайджана, одним из главных аспектов этой деятельности является то, что в ходе реформ ни один медицинский работник не был сокращен.

В 2009 году в районах республики количество коечных мест было сокращено на 50-55%, а число самих стационаров - на 50%.

Кроме того, в 2009 году в Азербайджане было построено, капитально отремонтировано и реконструировано более 60 медицинских учреждений первостепенной важности. Среди них Республиканский центр талассемии, Национальный центр офтальмологии, Национальный онкологический центр (новый корпус), Республиканский перинатальный центр, Республиканская клиническая урологическая больница и другие.